More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3055 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  354  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  40.76 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  36.16 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.86 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  59.68 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 251 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  27.23 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>