More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2588 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  359  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  41.85 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  35.56 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 197 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 220 aa  98.2  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 213 aa  97.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 198 aa  97.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 208 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 219 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 246 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.66 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  31.53 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 258 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  38.18 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>