More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5316 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  61.27 
 
 		 221 aa  254  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  49.55 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  37.32 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  66.07 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  59.02 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  32.24 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  37.66 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  31.52 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.68 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  42.59 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 335 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 125 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 332 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 277 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>