More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3673 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  51.42 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  51 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  49.77 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  43.26 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  43.88 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  44.91 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  46.55 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  50.85 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  51.85 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  51.85 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  51.85 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 194 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  43.66 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  44.44 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  40 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 126 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 175 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  46.15 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>