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for query gene Strop_0261 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  83.56 
 
 		 217 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 193 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  58.44 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  40.97 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 226 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  34.84 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.16 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  22.03 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.5 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  50 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 205 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
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NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  36.56 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
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NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 200 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
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