136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2617 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  36.42 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  30.41 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  28.24 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  56 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  32.47 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  42.19 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  36.14 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>