80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2499 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  87 
 
 		 202 aa  348  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  29.48 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0986  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  21.5 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 414 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 227 aa  44.7  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 423 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  31.17 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 469 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 203 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 221 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 205 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 267 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 191 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  26.38 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>