More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2395 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  87.91 
 
 		 414 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 423 aa  865    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 196 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 193 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  34.23 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 255 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.22 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.21 
 
 		 226 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 200 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 206 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 201 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 289 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  23.03 
 
 		 206 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 218 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 209 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 222 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 218 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 218 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 218 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 191 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 214 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 210 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 244 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 200 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 195 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  49.02 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 193 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 187 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 277 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 213 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 192 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 212 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 235 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 208 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 206 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 236 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 220 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 230 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 197 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 198 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  50.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 235 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>