More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  60.12 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  44.68 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  46.85 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  48.59 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  43.32 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  43.17 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  43.05 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
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NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
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NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  43.48 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
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