203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  47.22 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  46.46 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  47.34 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  46.32 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 245 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  42.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  72.41 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  29.7 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>