More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2038 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  81.34 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 200 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 200 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 200 aa  220  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  47.12 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  48.09 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  51.48 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  46.95 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  46.94 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  47.48 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  45.96 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  89.66 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  50.79 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.23 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1393  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>