More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1571 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  53.37 
 
 		 200 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  48.06 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  50.5 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  56.91 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.32 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  51.66 
 
 		 188 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 183 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  46.1 
 
 		 195 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  38.81 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  34.78 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 424 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>