279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3019 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  61.33 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  46.49 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  52.45 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  43.65 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  44.63 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  45.31 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  37.1 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 268 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  42.86 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  28.45 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 421 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 403 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>