More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4018 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  433  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  72.59 
 
 		 224 aa  244  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  48.63 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  42.21 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  47.72 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  50.38 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  34.44 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 245 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  39.73 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 403 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  40.85 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  49.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  42.25 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>