More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0662 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  73.42 
 
 		 268 aa  320  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  30.34 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  28.32 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.85 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  33.33 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  33.65 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  33.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  33.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.35 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  33.65 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  30.61 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.25 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>