More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0121 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  32.31 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  27.81 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  35.82 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 497 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 74 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>