136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3518 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  41.35 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  36.45 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  34.02 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 376 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  25.9 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>