More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3501 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  92.82 
 
 		 209 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  96.04 
 
 		 202 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  52.02 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  52.02 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  47.66 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  41.61 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  43.7 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.64 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  48.28 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 74 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  29.79 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  41.98 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  33.72 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0885  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  34.26 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>