More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3465 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 74 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  41.41 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  36.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>