More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0153 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  49.17 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  42.98 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  42.96 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  44.34 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  65.57 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  43.12 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  50.7 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5322  hypothetical protein  43.52 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.98 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
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NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
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NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  38.38 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
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