More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1272 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 176 aa  347  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 198 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  53.21 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 225 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  62.96 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  59.09 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  62.26 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  62.26 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  38.83 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  34.96 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 74 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  49.23 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  65 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  65 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 263 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
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NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
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NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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