More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1213 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  47.22 
 
 		 232 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.72 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.5 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  55.56 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.39 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  39.73 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  29.95 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>