More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04693 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  46.39 
 
 		 188 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  32.04 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  30.07 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  51.02 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  47.46 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  27.52 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  43.55 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  46.27 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.85 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>