More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5065 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.34 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.12 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.63 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  28.47 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  28.29 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  32.31 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>