286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2606 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  51.74 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.6 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  24.08 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  55.1 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  25.74 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  28.95 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  25.62 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 423 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.82 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 414 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  22.5 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 403 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  22.89 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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