More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5568 on replicon NC_011730
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 414 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  87.91 
 
 		 423 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  27.08 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.74 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.85 
 
 		 201 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 255 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 203 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 188 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 186 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  24.24 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 201 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 210 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 202 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 200 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 200 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 207 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 199 aa  53.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 218 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 200 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 187 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  49.02 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 197 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 278 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 278 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>