More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2276 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 403 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  60.43 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  61.18 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 201 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  27.6 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 200 aa  57  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 250 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  23.16 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 200 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 212 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 228 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1917  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 192 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 202 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 216 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 203 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  47.37 
 
 		 226 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 190 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 216 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 203 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  50.98 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 214 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  34.04 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  41.03 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  50.98 
 
 		 181 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 210 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 205 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>