More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13864 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  70 
 
 		 201 aa  267  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  69.5 
 
 		 202 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  28.72 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 414 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.26 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  46 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 423 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.88 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>