More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5062 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  86.63 
 
 		 204 aa  351  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  64.77 
 
 		 198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  54.5 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  28.89 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0880  hypothetical protein  35.04 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.61 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 406 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>