More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3172 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 246 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.75 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  49.45 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.68 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 393 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>