More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3406 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  50.28 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  52.81 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  54.65 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  42.75 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.78 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 388 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>