More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  54.93 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  59.15 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  61.82 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  39.78 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  43.18 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.58 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.94 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.82 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  50.82 
 
 		 71 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  38.79 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>