More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  53.01 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  42.5 
 
 		 248 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  39.08 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  34.29 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>