More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  42.4 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  49.61 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.91 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.43 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  47.46 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>