More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0409 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  98.44 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 215 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  38.15 
 
 		 248 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  62.71 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  59.65 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  38.6 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  45.45 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  56.14 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.71 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  54.39 
 
 		 71 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>