More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3604 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  97.55 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  90.15 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  90.15 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  90.15 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 206 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  82.05 
 
 		 239 aa  321  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  58.14 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  29.24 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  58.54 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  51.22 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  42.03 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  24.31 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  30.64 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.06 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>