More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0667 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  49 
 
 		 246 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  58.02 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  41.09 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  42.75 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.35 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  54.93 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  35 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  45.97 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  42.97 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
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NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
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NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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