More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0274 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  35.2 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  55.07 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  38.51 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  32.64 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.7 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.77 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36.72 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  33.7 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  54.69 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  47.54 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>