More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0267 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  67.24 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  68.42 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  39.63 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  59.65 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  60.34 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  54.29 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4392  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  53.52 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.4 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  45.12 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  44.44 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  50.88 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  70.27 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>