More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1026 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 208 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  69.79 
 
 		 198 aa  270  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  51.32 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  45.79 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.05 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  41.84 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0880  hypothetical protein  30.88 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 446 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  22.34 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  27.2 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>