More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1547 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 236 aa  91.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.68 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  42.75 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.88 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  45.97 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.53 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  61.02 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  32.91 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  34.27 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.57 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  37.38 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>