More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2561 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  45.36 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  60.66 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.99 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  46.97 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.18 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>