286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3143 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
209 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  36.87 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  52.75 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  30.53 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 
208 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  38.71 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 
215 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 
192 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 
205 aa  58.5  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  44.93 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  57.14 
 
 
213 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
208 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
192 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 
214 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
191 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
191 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
202 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
191 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
200 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  31.55 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.87 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
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NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
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