More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5092 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  48.96 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  32.37 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  61.54 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  35.04 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  25.2 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 90 aa  52  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>