More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1927 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  54.3 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  58.01 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  52.15 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  57.84 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  48.85 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  38.6 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.78 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 236 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.8 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  32.89 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  33.73 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  26.97 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.03 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  28.23 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 423 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>