More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2308 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  55.84 
 
 		 202 aa  231  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  54.4 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.74 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.1 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  26.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  27.62 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  27.14 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>