More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36.81 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.43 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.49 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.72 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  54.44 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  30.32 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.37 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  61.4 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>