More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4412 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  38.79 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  34.62 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  37.11 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.48 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 191 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.83 
 
 		 188 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  37 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  31.71 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  24.69 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 198 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  52.73 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.82 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>