More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5390 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  51.65 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  52.43 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  49.16 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 198 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  50.54 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  46.23 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  51.1 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  45.73 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  35.58 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.12 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.72 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  37.19 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 423 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 414 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  39.73 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>