More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3564 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  54.44 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40.99 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  53.01 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  45.76 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  52.54 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  47.31 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  40.7 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>